牙本質(zhì)齲多是由釉質(zhì)齲進一步向深層發(fā)展所致，部分也可由牙根部牙骨質(zhì)齲發(fā)展而來。
牙本質(zhì)內(nèi)含有機物較多，故其齲性損害除了有無機晶體的溶解外，還存在有機基質(zhì)的分解破壞。牙本質(zhì)內(nèi)有牙本質(zhì)小管，內(nèi)有成牙本質(zhì)細胞突起，牙本質(zhì)齲是沿著牙本質(zhì)小管進展的，故發(fā)展較快。牙髓牙本質(zhì)為一復合體，牙髓組織有防御性反應，表現(xiàn)為修復性牙本質(zhì)、硬化牙本質(zhì)的形成。
釉質(zhì)齲、牙骨質(zhì)齲向深層發(fā)展達牙本質(zhì)時，病變可沿釉質(zhì)牙本質(zhì)界、牙骨質(zhì)牙本質(zhì)界向兩側擴展，并由此沿牙本質(zhì)小管深入，早期使緊接釉質(zhì)病損前沿的牙本質(zhì)發(fā)生脫礦，由于在脫礦深層區(qū)域pH相對較高，在此微環(huán)境中礦物離子易重新沉積，使牙本質(zhì)小管內(nèi)礦化。這種小管的再礦化現(xiàn)象發(fā)生于齲病進展較慢時，其形成有助于阻止外來有害物質(zhì)的進入。齲病進一步進展，細菌侵入牙本質(zhì)小管，并可沿側支小管擴散，每一小管內(nèi)常為一種細菌。細菌除進一步產(chǎn)酸使管周、管間牙本質(zhì)脫礦外，同時產(chǎn)生的蛋白溶解酶使基質(zhì)中的有機物溶解，小管擴張變形，最終結構破壞，相鄰小管相互融合成壞死灶。壞死灶繼續(xù)擴大，以致大片結構崩解，最終齲洞形成。
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