A.設(shè)區(qū)的市的地方性法規(guī)由省、自治區(qū)的人民代表大會常務委員會報送備案

B.自治條例、單行條例報送備案時，應當說明對上位法作出變通的情況

C.行政法規(guī)由國務院報全國人民代表大會備案

D.部門規(guī)章報國務院備案

E.根據(jù)授權(quán)制定的法規(guī)應當報授權(quán)決定規(guī)定的機關(guān)備案

正確答案：B、D、E

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答案解析:（1）A錯誤，設(shè)區(qū)的市以及自治州的由全國人民代表大會及常務委員會制定的地方性法規(guī)由省、自治區(qū)的人民代表大會常務委員會報全國人民代表大會常務委員會和國務院備案。
（2）自治條例、單行條例報送備案時，應當說明對法律、行政法規(guī)、地方性法規(guī)（上位法）作出變通的情況，B正確。
（3）行政法規(guī)報全國人民代表大會常務委員會備案，C錯誤。
（4）部門規(guī)章和地方性政府規(guī)章應報國務院備案，D正確。
（5）根據(jù)授權(quán)制定的法規(guī)應當報授權(quán)決定規(guī)定的機關(guān)備案，E正確。