全國目前有32所副部級大學，普遍認為“副部級大學”是當前國內(nèi)最頂尖的大學。這些高校的校長、書記等高層領(lǐng)導由中共中央、中央組織部聯(lián)合任命，而非通常的教育部任命。

　　副部級大學只是一般的俗稱，嚴格意義上，國內(nèi)的普通本科高校都是正局級單位，但是，有一些高校因為合并，政策照顧等等原因，這些高校的黨委書記和校長高配為副部級，由中組部管理。

　　1、清華大學

　　一級學科國家重點學科：數(shù)學、物理學、生物學、力學、機械工程、光學工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、電子科學與技術(shù)、信息與通信工程、控制科學與工程、計算機科學與技術(shù)、建筑學、土木工程、水利工程、化學工程與技術(shù)、核科學與技術(shù)、生物醫(yī)學工程、管理科學與工程、工商管理、藥學

　　2、北京大學

　　一級學科國家重點學科：哲學、理論經(jīng)濟學、法學、政治學、社會學、中國語言文學、歷史學、數(shù)學、物理學、化學、地理學、大氣科學、生物學、力學、電子科學與技術(shù)、計算機科學與技術(shù)、口腔醫(yī)學、藥學

　　3、中國人民大學

　　一級學科國家重點學科：哲學、理論經(jīng)濟學、應用經(jīng)濟學、法學、社會學、馬克思主義理論、新聞傳播學、工商管理

　　4、北京師范大學

　　一級學科國家重點學科：教育學、心理學、中國語言文學、數(shù)學、地理學、馬克思主義哲學、民俗學、史學理論與史學史、中國古代史理論、物理、物理化學、細胞生物學、生態(tài)學、系統(tǒng)理論、環(huán)境科學、教育經(jīng)濟與管理

　　5、哈爾濱工業(yè)大學

　　國家重點學科一級學科：力學、機械工程、儀器科學與技術(shù)、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、控制科學與工程、計算機科學與技術(shù)、土木工程、管理科學與工程

　　6、北京航空航天大學

　　一級學科國家重點學科：管理科學與工程，航空宇航科學與技術(shù)，計算機科學與技術(shù)，控制科學與工程，材料科學與工程，儀器科學與技術(shù)，機械工程，力學

　　7、中國農(nóng)業(yè)大學

　　一級學科國家重點學科：作物學、植物保護、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、畜牧學、獸醫(yī)學、農(nóng)業(yè)工程

　　8、北京理工大學

　　一級學科國家重點學科：機械工程、光學工程、信息與通信工程、兵器科學與技術(shù)

　　9、中國科學技術(shù)大學

　　一級學科國家重點學科：數(shù)學、物理學、化學、地球物理學、生物學、科學技術(shù)史、力學、核科學與技術(shù)

　　10、復旦大學

　　一級學科國家重點學科：哲學、理論經(jīng)濟學、中國語言文學、新聞傳播學、數(shù)學、物理學、生物學、化學、電子科學與技術(shù)、基礎(chǔ)醫(yī)學、中西醫(yī)結(jié)合

　　11、上海交通大學

　　一級學科國家重點學科：船舶與海洋工程、機械工程、生物醫(yī)學工程、力學、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、控制科學與工程、計算機科學與技術(shù)、管理科學與工程

　　12、西安交通大學

　　一級學科國家重點學科：機械工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、控制科學與工程、生物醫(yī)學工程、管理科學與工程、工商管理

　　13、西北工業(yè)大學

　　一級學科國家重點學科：材料科學與工程、航空宇航科學與技術(shù)

　　14、浙江大學

　　一級學科國家重點學科：數(shù)學、化學、機械工程、光學工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、控制科學與工程、電氣工程、土木工程、生物醫(yī)學工程、園藝學、農(nóng)業(yè)資源利用、植物保護、管理科學與工程

　　15、南京大學

　　一級學科國家重點學科：中國語言文學、數(shù)學、物理學、化學、天文學、地質(zhì)學、生物學、計算機科學與技術(shù)學

　　16、中山大學

　　一級學科國家重點學科：生物學、工商管理

　　17、南開大學

　　一級學科國家重點學科：理論經(jīng)濟學、應用經(jīng)濟學、數(shù)學、化學、光學工程、歷史學

　　18、武漢大學

　　一級學科國家重點學科：理論經(jīng)濟學、生物學、水利工程、測繪科學與技術(shù)、圖書館、情報與檔案管理

　　19、四川大學

　　一級學科國家重點學科：中國語言文學、數(shù)學、材料科學與工程、生物醫(yī)學工程、口腔醫(yī)學

　　20、天津大學

　　一級學科國家重點學科：化學工程與工藝、光學工程、儀器科學與技術(shù)、材料科學與工程、建筑學、水利工程、管理科學與工程

　　21、中南大學

　　一級學科國家重點學科：機械工程、土木工程、材料科學與工程、交通運輸工程、礦業(yè)工程、管理科學與工程、臨床醫(yī)學

　　22、華中科技大學

　　一級學科國家重點學科：機械工程、光學工程、材料科學與工程、動力工程及工程熱物理、電氣工程、控制科學與工程、生物醫(yī)學工程

　　23、山東大學

　　一級學科國家重點學科：材料科學與工程、數(shù)學

　　24、廈門大學

　　一級學科國家重點學科：理論經(jīng)濟學、應用經(jīng)濟學、化學、海洋科學、工商管理

　　25、同濟大學

　　一級學科國家重點學科：建筑學、土木工程、交通運輸工

　　26、西北農(nóng)林科技大學

　　一級學科國家重點學科：植物病理學、土壤學、農(nóng)業(yè)水土工程、臨床獸醫(yī)學、果樹學、動物遺傳育種與繁殖、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟管理

　　27、大連理工大學

　　一級學科國家重點學科：力學、水利工程、化學工程與技術(shù)、管理科學與工程

　　28、吉林大學

　　一級學科國家重點學科：數(shù)學、化學、機械工程、地質(zhì)資源與地質(zhì)工程、基礎(chǔ)醫(yī)學、基礎(chǔ)獸醫(yī)學

　　29、重慶大學

　　一級學科國家重點學科：機械工程、電氣工程、生物醫(yī)學工程

　　30、東南大學

　　一級學科國家重點學科：電子科學與技術(shù)、信息與通信工程、建筑學、交通運輸工程、生物醫(yī)學工程

　　31、蘭州大學

　　一級學科國家重點學科：固體力學、生態(tài)學、植物學、自然地理學、有機化學、粒子物理與原子核物理、民族學、區(qū)域經(jīng)濟學

　　32、國防科學技術(shù)大學

　　為副大軍區(qū)級，屬中國人民解放軍中央軍委直屬院校，對應地方行政級別為副部級。