金門(mén)通行證和臺(tái)灣通行證是兩種不同的證件，雖然它們都可以用于臺(tái)灣地區(qū)的出入境。金門(mén)通行證是發(fā)放給持有大陸居民身份證的居民前往金門(mén)地區(qū)旅游、探親、商務(wù)等目的的證件，而臺(tái)灣通行證則是發(fā)放給外籍人士或持有其他國(guó)家護(hù)照的人前往臺(tái)灣地區(qū)旅游、探親、商務(wù)等目的的證件。

除了發(fā)放對(duì)象不同，金門(mén)通行證和臺(tái)灣通行證的辦理流程和要求也有所不同。持有大陸居民身份證的申請(qǐng)人需要提供身份證和其他相關(guān)材料，如旅游行程證明、探親關(guān)系證明等，申請(qǐng)金門(mén)通行證。而申請(qǐng)臺(tái)灣通行證則需要提供護(hù)照、簽證申請(qǐng)表、旅游行程證明等。此外，兩種證件的有效期和使用范圍也不同。金門(mén)通行證有效期為1年，僅可用于進(jìn)出金門(mén)地區(qū)；而臺(tái)灣通行證有效期根據(jù)簽發(fā)目的不同而有所不同，可用于進(jìn)出臺(tái)灣地區(qū)。

總之，雖然金門(mén)通行證和臺(tái)灣通行證都是用于進(jìn)出臺(tái)灣地區(qū)的證件，但是它們的持有對(duì)象、辦理流程、要求、有效期和使用范圍等方面都有所不同。因此，申請(qǐng)人在選擇辦理哪種證件時(shí)，應(yīng)根據(jù)自己的具體情況和需要仔細(xì)選擇，并遵守相關(guān)的申請(qǐng)和使用規(guī)定。