《刺客信條》系列游戲的故事背景設(shè)定在歷史上的不同時期，講述了刺客組織和圣殿騎士團之間的斗爭。而《刺客信條：兄弟會》是系列游戲中的一部分，講述的是主角艾吉奧·奧迪托雷在意大利文藝復(fù)興時期加入刺客組織，并與圣殿騎士團展開一系列斗爭的故事。

在游戲的結(jié)局中，艾吉奧最終成功地打敗了圣殿騎士團的首領(lǐng)羅德里戈·波吉亞，并將波吉亞家族的掌控權(quán)交給了教皇。艾吉奧也在故事的最后與他的導(dǎo)師、刺客組織的領(lǐng)袖馬里奧·奧迪托雷重逢，馬里奧也承認了艾吉奧是他的一位杰出學生，并稱贊了他在斗爭中的表現(xiàn)。

然而，故事的結(jié)局并不是這樣結(jié)束的。在游戲的劇情中，艾吉奧所面臨的威脅并不僅僅來自圣殿騎士團，還有來自另一個組織——The Instruments of the First Will。這個組織出現(xiàn)在游戲的最后階段，他們試圖利用一件名為“蘇菲的鑰匙”的神器來改變歷史的進程。而艾吉奧也意識到，這個組織才是真正的威脅，他必須繼續(xù)保持警惕。

因此，游戲的結(jié)局并不是一個完美的結(jié)局，雖然艾吉奧打敗了波吉亞家族，但是他面臨的威脅并沒有結(jié)束。在后續(xù)的游戲中，The Instruments of the First Will成為了主要的敵人，并且艾吉奧也一直在為保護人類的自由而戰(zhàn)斗。